曙光超级计算机云大HIV病毒研究应用案例-服务器（server）解决方案

曙光超级计算机云HIV病毒研究应案例服务器(server)解决方案
　　HIV病毒研究国科学家非常关注重课题分析研究需进行量高密度计算计算机性性研究进展起非常关键作日云南学科研员新引进曙光4000A超级计算机进行HIV 病毒gp120 糖蛋白分子动力学模拟实验运算时间通单机需星期缩短13时

　　西陲名校困惑

　　位中国西陲云南学已拥80余年历史国家211工程重点建设高校着教学科研工作断深入学科型密集高性计算需求日俱增材料科学信息科学数理化生命科学理气科学科研员急需提供高性计算服务台分散学院实验室现计算资源法满足规模计算需求

　　解决矛盾云南学 211建设费中划拨出专款建高水高性计算中心中心仅实现高速网络环境种计算资源效聚合充分享学科提供高性计算服务云南省重领域型计算软件开发提供支撑逐步形成学科交叉创新研究台

　　海超算启示

　　海超算采中国快超级计算机10万亿曙光4000A成功部署国家网格海信息服务台做法国外引起广泛关注样成云南学参考样板云南学领导海超算曙光公司进行实考察曙光技术支持部高性计算测试实验室中进行软件测试采曙光4000A搭建高性计算中心蓝图开始萌生

　　9月云南学高性计算中心正式成立新引进曙光4000A开始投入运行套基机群架构超级计算机系统采96颗AMD皓龙处理器配备192GB海量存2044GB外部存储峰值计算速度达秒 3840 亿次11月公布2005年中国高性计算机性TOP 100排行榜中排第89位中心通采国际标准超级计算机性测试标准 HPL 程序曙光4000A进行 Linpack 测试系统 Linpack 运算峰值 7583 海超算曙光4000A 高出4百分点

　　云高性计算中心技术负责介绍说引进曙光4000A中等规模机群系统高速计算网存储接入网理监控网等3套网络组成中24计算节点全部采2U高密度机架式四路服务器天阔R4280A该服务器采AMD皓龙64位处理器具直连架构HT超传输技术集成存控制器等特点加曙光研发设计四路板节点机机群系统性稳定性保障该款产品仅海超算部署500节点均障运行时间达25万时惊品质

　　曙光4000A初显身手

　　试运行阶段高性计算中心联合校家相关研究单位针成熟高性计算应课题做初期联合测试测试结果达预期性指标生命科学院生物资源保护利重点实验室 Gromacs 分子动力学模拟软件事 HIV 病毒 gp120 糖蛋白分子动力学模拟实验运行 24 节点节点 1CPU 条件1ns 蛋白质结构模拟仅需13时单机运行整整星期资源环境球科学学院气数值模拟实验室进行黑炭气溶胶辐射气候效应数值试验通区域气候模式 Regcm3 模式 20012002 年 BC 气候效应进行数值模拟普通 PC 单机运行需 96 时目前该系统单节点仅需 48 时缩短半
　　

　　目前高性计算中心前期调研基础部署许应软件涉规模非线形复杂系统计算模拟限元计算流体动力学计算模拟分子动力学计算力场模拟计算化学药物筛选等领域校户已通网络远程登陆提交相关计算作业

　　云高性计算中心副李汉斌表示：尝试搭建集成系统十分稳定速度慢次采曙光4000A机群服务器稳定性非常目前没出现宕机现象速度明显提高倍曙光4000A机群系统引入效解决云材料科学生命科学气科学等学科基础研究高性计算应需求时云南行业科学研究济建设提供良服务

　　更推动高性计算云南省科学研究济建设中应进步提高云南省科技创新力云南省培养高性计算研发应方面高层次专门云高性计算中心先中科院计算海超算曙光 AMD中科院昆明植物海药物等家单位建立全面合作关系相继成立海超算云南学分中心云南学中科院计算高性计算联合实验室云南学曙光公司高性计算技术支持中心AMD64高性计算教学科研实验室等研发台推动云深入开展高性计算教学科研应奠定良基础

　　曙光公司销售总监王成江表示着机群技术日渐成熟机群服务器已教育城域网高校信息化教育科研网格建设中广泛青睐西部四十高校校园网北京烟台海南阳等城域网中山学北京邮电学等重点高校教育科研网格项目中曙光机群服务器中TC1700曙光3000新代曙光4000系列机群服务器实现广泛部署云南学高性计算中心建立曙光4000A成功运行西南区高性
计算应起非常示范辐射效应带动行业通高性计算提升业务效率科技竞争力

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z***5

贡献于2015-09-06

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