蛋白质结构新进展
锡 江南学 理学院 陈良康 学号6171202012
摘
蛋白质特定功特定构象决定种蛋白质特定构象级结构密切相关天然蛋白质构象旦发生变化必然会影响生物活性蛋白质构象变化引起蛋白质功变化导致蛋白质构象紊乱症然引起生物体环境适应性增强文阐述研究蛋白质结构方法蛋白质结构模型蛋白结构领域中应着蛋白质领域增加 迫切需知道环境中结构特征生物活性目前 测定蛋白质结构方法 包括 X射线衍射技术核磁振波谱学圆二色光谱(CD)FTIR等蛋白质结构包括级结构二级结构超二级结构三级结构四级结构等蛋白质组学结构生物学进步应提供见解
关键词：蛋白质结构模型应基
Recent advances in protein structure
Abstract
The specific functions of proteins are determined by their specific conformations and the specific conformations of various proteins are closely related to their primary structure Once the conformation of natural protein changes it will inevitably affect its biological activity Due to changes in the conformation of proteins the changes in protein function can lead to protein conformation disorder which can also lead to the increase of the organism's adaptability to the environmentThis paper mainly describes the structure of protein structure and the application of protein structure in the field With the increase of protein use it is urgent to know its structural characteristics and biological activity in different environmentsAt present there are many methods to determine protein structure including Xray diffraction technique nuclear magnetic resonance spectroscopy circular dichromatic spectrum (CD) ftir etc The structure of the protein includes the first class structure secondary structure super secondary structure tertiary structure and cet4 structure It also provides insights into the further application of proteomics and structural biology
Key Words proteinstructuremodelapplicationgene
1引言
然界生命现象样性蛋白质样性决定蛋白质功结构紧密相关蛋白质具重生物学功：作生物催化剂（酶）代谢调节作免疫保护作物质转运存储运动支持作参细胞间信息传递
蛋白质结构极复杂目前结构水分级结构高级结构进行研究发现级结构决定高级结构(二三四级结构)级结构发生改变时蛋白质功迥异完全丧失活性新生肤链折登研究解决基工程蛋白质工程方法生产生物活性蛋白质关键蛋白质空间结构肤链折叠生物功研究蛋白质科学研究重前领域目前 蛋白质序列数库数积累速度非常快 已知结构蛋白质相较少
20世纪60年代期 Christian Anfinsen[1]首先发现折叠蛋白者说变性蛋白质允许重新折叠实验条件重新折叠原结构 种天然结构行生物功具重作 数蛋白质折叠成天然结构时候具完全生物活性提出蛋白质折叠信息隐含蛋白质级结构中 科学家蛋白质结构预测进行量研究 分子生物学家直接运适算法氨基酸序列出发 预测蛋白质结构
2蛋白质结构概念
蛋白质20种氨基酸组成肽链构成CHON S蛋白质含少量磷金属元素铁铜锌锰钴钼蛋白质含碘种蛋白质含氮量接均16％体含氮物质蛋白质测定生物样品中含氮量根公式推算出蛋白质致含量：100克样品中蛋白质含量 (g ) 克样品含氮克数× 625×100
蛋白质分子结构包括 级结构(primary structure)二级结构(secondary structure)三级结构(tertiary structure)四级结构(quaternary structure)描述成4级层次结构中级结构指构成肽链氨基酸排列序种维信息二级结构相邻连续干氨基酸局部空间折叠形成具定规片段子结构α螺旋结构β折叠结构回折结构三级结构指规二级结构进步折叠形成三维空间形状四级结构指干条肽链相互作形成稳定空间结构维氨基酸序列没进行空间折叠前没功意义二级结构蛋白质空间结构基单元间相互作形成超二级结构种二级三级结构转化中间结构
αβα超二级结构进步组合形成定功结构域成基功实体尚具备完整生物活性空间然折叠三维形状终决定蛋白质功[2]
蛋白质二级结构分析图1
蛋白质二级结构分析图2
蛋白质级结构指蛋白质肽链中氨基酸排列序蛋白质肽链中氨基酸排列序相似时功基相似促甲状腺素释放激素(TRH)序焦谷氨酸组氨酸脯氨酞胺组成三肽TRH中组氨酸(His)基氨酸(Phe)色氨酸(Trp)酪氨酸(Tyr)取代TRH活性程度减弱特定氨基酸残基功具重作催产素抗利尿激素(ADH)级结构相似八 中两氨基酸两者生理功类似活性差催产素促进子宫收缩时具微弱ADH 活性ADH作抗利尿增血压具微弱催产活性
蛋白质二级结构指蛋白质链原子局部空间排列涉肽链片段间相互关系侧链构象(表现链氢键稳定肤链身旋转折叠方式)三种基类型Q螺旋件折叠卜转角规卷曲等
超二级结构干相邻二级结构单元组合起彼相互作形成规空间辨认二级结构组合体充三级结构 构件没完整结构域 (dm al)n
蛋白质三级结构指链侧链构象相互作肤链二级结构基础进步空间卷曲折迭包括(1)全
Q螺旋(2) 全卜折叠(3)a螺旋件折叠交(4)a螺旋折叠分聚集存结构单元a螺旋件折叠两种
蛋白质四级结构二条更条肤链组成具二三级结构亚基间非价键互相连接契合成蛋白质分子血红蛋白四亚基组成功单位简单四聚体两条相a链两条 p链组成肌红蛋白四倍肌红蛋白结构相血红蛋白亚基血红蛋白Q链p链肌红蛋白相似量右a螺旋区相似长度弯折角度方功相似全相[3]
信号肽分析图谱
磷酸化位点图
3蛋白质结构研究方法
研究蛋白质结构方法分2种实验测定理预测实验测定蛋白质三维结构方法采X射线晶体衍射法(Xray diffraction method)核磁振波谱法(nuclearmagnetic resonance spectroscopyNMR)X射线衍射法[4]目前效结构测定方法包括蛋白质晶体形成培养没普遍适规律晶体结构测定周期较长蛋白质难形成结晶(例膜蛋白般溶水水溶液中容易聚集溶性物质)等缺点X射线衍射法测定蛋白质结构中应受限制维核磁振波谱法直接测定蛋白质溶液中构象般测相分子质量2×104
u蛋白质结构求蛋白质中含量重复结构该方法样品纯度求较高样品需量
蛋白质序列数库(SwissProt)序列数增长极快2006年2月报道蛋白质序列条目超20万[5]相已测定结构蛋白质数目较少(3万)缩已知序列蛋白质数量已测定结构蛋白质数量二者间差距改善实验测定方法外急需建立完善理分析方法结构生物学重目标外分析处理海量蛋白质序列三维结构数理预测方法高通量动化成理想选择[6]
31 X射线晶体衍射法(Xray diffraction method)
X 射线晶体学早测定蛋白质结构方法第蛋白质三维结构——血红蛋白结构通Xray方法解析目前PDB中收录蛋白质结构85％左右利 X 射线晶体学方法解析蛋白质晶体结构 X射线衍射分析包含样品制备蛋白质结晶衍射数收集处理相位求解模型建立修正等五步骤试验24蛋白样检测操作6 成功结晶解出结构[7]
X射线晶体学缺点分子晶体中锁定某状态晶体分子处基态构象均分子行功时发生激发态渡态X 射线晶体技术难捕捉分子动态信息[8]样X射线晶体学方法现会蛋白质结构研究方法
32核磁振波谱学(nuclear magnetic resonanceNMR)
核磁振波谱学 X 射线晶体学力补充1971 年利时科学家J Jeener 提出二维核磁振概念1985 年Kurt Wüthrich 基础发明种新方法选择生物分子中质子(氢原子核)作测量象连续测定相邻两质子间距离方位数计算机处理形成生物分子三维结构图KurtWüthrich 该方法测定蛋白质三维结构奠定NMR作确定生物分子手段获2002 年诺贝尔化学奖时日NMR已成确定生物分子溶液三维空间结构手段[9]
NMR技术缺点测定蛋白中等蛋白质分子(相分子质量般30000)图谱分析工作极费时需数月年时间导致实验周期延长速度缓慢外核磁振衍射技术反应溶液中进行研究象必须溶蛋白溶蛋白研究较困难样品需位素标记等定程度制约NMR技术应着新技术发现G矩阵傅立叶变换式NMR(Gmatrix fouriertransform NMRGFTNMR)技术等NMR发展速度快目前PDB中收录蛋白质结构15％左右利NMR方法解析快速发展功方面：仪器技术断发展计算速度飞速提升实验方法断创新发展[8]1990年前均年解10结构现均天解2 结构相信着NMR技术断改进发展NMR技术未结构生物学贡献会越越
33圆二色光谱 (CD)
光学活性分子左右圆偏振光吸收左右圆偏振光透变成椭圆偏振光种现象圆二色性(Circular Dichroism简称ＣＤ)蛋白质具特定结构生物分子氨基酸通肽键连接成具级结构二级结构三级结构四级结构结构层次结构域超二级结构蛋白质肽分子中肽链骨架中肽键芳香氨基酸残基二硫桥键光活性生色基团面圆偏振光通时生色基团左右圆偏振光吸收造成偏振光矢量振幅差圆偏振光变成椭圆偏振光产生蛋白质圆二色性[10]圆二色光谱种差光谱样品左右旋偏振光射吸收光谱差值[11]
34FTIR
蛋白质结构研究代生物化学领域研究基容 蛋白质结构复杂变性形成复杂生物组织前提基础 许生理功实现蛋白质结构密切相关 着生命科学进步 仪器分析手段更新 傅立叶变换红外光谱(FTIR)附件发展运 尤年FTIR结构功方面应崛起 领域发展突飞猛进
FTIR技术蛋白质结构研究具优点：(1)需材料少受分子量影响 (2)适合种状态样品(3)受光散射 荧光影响(4)适合种环境 (5)易测定蛋白质瞬间结构特征 说明蛋白质生理状态结构功关系(6)操作简便 测量速度快
[12]
4蛋白质结构领域中应
41结构基组学中应
目前预测技术水[13]预测结果精确度X射线衍射分析NMR等实验手段蛋白质结构预测规模低成快速获三维结构效途径例目标蛋白质模板蛋白质序列相似性超30时结构预测方法建立蛋白质三维结构模型般性功分析蛋白质预测技术结构基组学中广泛应
2001年Dmitrijetal建立基组序列数进行高通量分析软件系统PEDANT相应基组分析服务器 PEDANT包括输入模块处理单元关系数库理系统户界面4模块应PEDANT预测拟南芥染色体IV识出3744编码蛋白质基基相应蛋白质中90蛋白质数库中搜索显著BLAST匹配2002年Scottetal开展极端嗜热菌海栖热袍菌(Thermotogamaritima)蛋白质组结构基组学高通量结构测定通道利测定通道成功克隆表达1376基占总预测数(1877)73分析432蛋白质结晶条件占蛋白质组232003年Manesh etal建立基串线法技术蛋白质结构预测动通道PROSPECT线虫(C elegans)嗜热菌(Pyrococcus furiosus)3种蓝细菌(cyanobacterial)基组进行结构基组学预测[14]
42药物设计中应
基组数新药物程分2部分：选择目标蛋白二选择合适药物[12]药物分子必需目标蛋白质分子紧密结合容易合成没毒副作传统药物设计通筛选量天然化合物已知底物配基类似物(analogs)生物化学研究确定前导物(lead compounds)较少赖目标蛋白质三维结构研发周期长费巨带少盲目性着蛋白质结构数增长结构预测技术发展目标蛋白质分子三维结构信息述2程发挥着越越作计算机辅助药物设计(computeraided drug design)缩短研发周期降低成例2003年Xiang etal
[14]应源建模方法建立SARS冠状病毒赖RNA聚合酶(SARSCov RdRp)分子模型抗SARS药物设计具重作
43蛋白质设计中应
蛋白质设计目标通计算机辅助算法生成符合目标蛋白质三维结构氨基酸序列漫长进化然界已筛选出数量众蛋白质天然蛋白质然条件发挥佳功利蛋白质受限制需蛋白质进行改造适应特定条件发挥特定功蛋白质分子设计分3类改中改改[15]
参考文献：
[1]李明苏显中敏郑全喜 蛋白质结构预测研究进展[J] 生物技术2009038790
[2]郭雨珍冯恩民 蛋白质结构研究现状展[J] 生物信息学200704182184
[3] 哀慧君 蛋 白质结构功研究进展新生肤链折叠[J] 河南职技师院学报1997033334
[4]阎隆飞孙荣蛋白质分子结构[M]北京清华学出版社1999211 213
[5]SwissProtSwissProtProteinKnowledgebaseRelease495Statistics[EBOL][2006 02 14] httpwww expasy ch sprotrelnotes relstat html
[6]宁正元林世强蛋白质结构预测应[J]福建农林学学报(然科学版)200605308311
[7] Pantazatos D Kim J S Kolck H E et al Rapid refinementof crystallographic protein construct definition employingenhanced hydrogendeuterium exchange MS Proc Natl AcadSci USA 2004 101(3) 751756
[8]蛋白质结构研究方法进展科学热点[Z]江南学图书馆情报部 2006 (2)
[9]阎隆飞 孙荣 蛋白质分子结构[M]北京 清华学出版社 1997 131154
[10]沈星灿梁宏锡文王新省圆二色分析蛋白质构象方法研究进展[Ｊ]分析化学评述进展2004(3)388～394
[11]丁晓岚高红旗圆二色光谱技术应实验方法[Ｊ]实验技术理200825(10)48～52
[12]王建华卫亚丽文宗河建川蛋白质结构 FTIR研究进展[J] 化学通报2004482
[13]刘东升王金凤结构基组学研究核磁振[J]生物化学生物物理进展200128(6)827 831
[14] 宁正元林世强蛋白质结构预测应[J]福建农林学学报(然科学版)200605310311
[15]鲁华蛋白质结构预测分子设计[M]北京北京学出版社1993100 105
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锡 江南学 理学院 陈良康 学号6171202012
摘
蛋白质特定功特定构象决定种蛋白质特定构象级结构密切相关天然蛋白质构象旦发生变化必然会影响生物活性蛋白质构象变化引起蛋白质功变化导致蛋白质构象紊乱症然引起生物体环境适应性增强文阐述研究蛋白质结构方法蛋白质结构模型蛋白结构领域中应着蛋白质领域增加 迫切需知道环境中结构特征生物活性目前 测定蛋白质结构方法 包括 X射线衍射技术核磁振波谱学圆二色光谱(CD)FTIR等蛋白质结构包括级结构二级结构超二级结构三级结构四级结构等蛋白质组学结构生物学进步应提供见解
关键词：蛋白质结构模型应基
Recent advances in protein structure
Abstract
The specific functions of proteins are determined by their specific conformations and the specific conformations of various proteins are closely related to their primary structure Once the conformation of natural protein changes it will inevitably affect its biological activity Due to changes in the conformation of proteins the changes in protein function can lead to protein conformation disorder which can also lead to the increase of the organism's adaptability to the environmentThis paper mainly describes the structure of protein structure and the application of protein structure in the field With the increase of protein use it is urgent to know its structural characteristics and biological activity in different environmentsAt present there are many methods to determine protein structure including Xray diffraction technique nuclear magnetic resonance spectroscopy circular dichromatic spectrum (CD) ftir etc The structure of the protein includes the first class structure secondary structure super secondary structure tertiary structure and cet4 structure It also provides insights into the further application of proteomics and structural biology
Key Words proteinstructuremodelapplicationgene
1引言
然界生命现象样性蛋白质样性决定蛋白质功结构紧密相关蛋白质具重生物学功：作生物催化剂（酶）代谢调节作免疫保护作物质转运存储运动支持作参细胞间信息传递
蛋白质结构极复杂目前结构水分级结构高级结构进行研究发现级结构决定高级结构(二三四级结构)级结构发生改变时蛋白质功迥异完全丧失活性新生肤链折登研究解决基工程蛋白质工程方法生产生物活性蛋白质关键蛋白质空间结构肤链折叠生物功研究蛋白质科学研究重前领域目前 蛋白质序列数库数积累速度非常快 已知结构蛋白质相较少
20世纪60年代期 Christian Anfinsen[1]首先发现折叠蛋白者说变性蛋白质允许重新折叠实验条件重新折叠原结构 种天然结构行生物功具重作 数蛋白质折叠成天然结构时候具完全生物活性提出蛋白质折叠信息隐含蛋白质级结构中 科学家蛋白质结构预测进行量研究 分子生物学家直接运适算法氨基酸序列出发 预测蛋白质结构
2蛋白质结构概念
蛋白质20种氨基酸组成肽链构成CHON S蛋白质含少量磷金属元素铁铜锌锰钴钼蛋白质含碘种蛋白质含氮量接均16％体含氮物质蛋白质测定生物样品中含氮量根公式推算出蛋白质致含量：100克样品中蛋白质含量 (g ) 克样品含氮克数× 625×100
蛋白质分子结构包括 级结构(primary structure)二级结构(secondary structure)三级结构(tertiary structure)四级结构(quaternary structure)描述成4级层次结构中级结构指构成肽链氨基酸排列序种维信息二级结构相邻连续干氨基酸局部空间折叠形成具定规片段子结构α螺旋结构β折叠结构回折结构三级结构指规二级结构进步折叠形成三维空间形状四级结构指干条肽链相互作形成稳定空间结构维氨基酸序列没进行空间折叠前没功意义二级结构蛋白质空间结构基单元间相互作形成超二级结构种二级三级结构转化中间结构
αβα超二级结构进步组合形成定功结构域成基功实体尚具备完整生物活性空间然折叠三维形状终决定蛋白质功[2]
蛋白质二级结构分析图1
蛋白质二级结构分析图2
蛋白质级结构指蛋白质肽链中氨基酸排列序蛋白质肽链中氨基酸排列序相似时功基相似促甲状腺素释放激素(TRH)序焦谷氨酸组氨酸脯氨酞胺组成三肽TRH中组氨酸(His)基氨酸(Phe)色氨酸(Trp)酪氨酸(Tyr)取代TRH活性程度减弱特定氨基酸残基功具重作催产素抗利尿激素(ADH)级结构相似八 中两氨基酸两者生理功类似活性差催产素促进子宫收缩时具微弱ADH 活性ADH作抗利尿增血压具微弱催产活性
蛋白质二级结构指蛋白质链原子局部空间排列涉肽链片段间相互关系侧链构象(表现链氢键稳定肤链身旋转折叠方式)三种基类型Q螺旋件折叠卜转角规卷曲等
超二级结构干相邻二级结构单元组合起彼相互作形成规空间辨认二级结构组合体充三级结构 构件没完整结构域 (dm al)n
蛋白质三级结构指链侧链构象相互作肤链二级结构基础进步空间卷曲折迭包括(1)全
Q螺旋(2) 全卜折叠(3)a螺旋件折叠交(4)a螺旋折叠分聚集存结构单元a螺旋件折叠两种
蛋白质四级结构二条更条肤链组成具二三级结构亚基间非价键互相连接契合成蛋白质分子血红蛋白四亚基组成功单位简单四聚体两条相a链两条 p链组成肌红蛋白四倍肌红蛋白结构相血红蛋白亚基血红蛋白Q链p链肌红蛋白相似量右a螺旋区相似长度弯折角度方功相似全相[3]
信号肽分析图谱
磷酸化位点图
3蛋白质结构研究方法
研究蛋白质结构方法分2种实验测定理预测实验测定蛋白质三维结构方法采X射线晶体衍射法(Xray diffraction method)核磁振波谱法(nuclearmagnetic resonance spectroscopyNMR)X射线衍射法[4]目前效结构测定方法包括蛋白质晶体形成培养没普遍适规律晶体结构测定周期较长蛋白质难形成结晶(例膜蛋白般溶水水溶液中容易聚集溶性物质)等缺点X射线衍射法测定蛋白质结构中应受限制维核磁振波谱法直接测定蛋白质溶液中构象般测相分子质量2×104
u蛋白质结构求蛋白质中含量重复结构该方法样品纯度求较高样品需量
蛋白质序列数库(SwissProt)序列数增长极快2006年2月报道蛋白质序列条目超20万[5]相已测定结构蛋白质数目较少(3万)缩已知序列蛋白质数量已测定结构蛋白质数量二者间差距改善实验测定方法外急需建立完善理分析方法结构生物学重目标外分析处理海量蛋白质序列三维结构数理预测方法高通量动化成理想选择[6]
31 X射线晶体衍射法(Xray diffraction method)
X 射线晶体学早测定蛋白质结构方法第蛋白质三维结构——血红蛋白结构通Xray方法解析目前PDB中收录蛋白质结构85％左右利 X 射线晶体学方法解析蛋白质晶体结构 X射线衍射分析包含样品制备蛋白质结晶衍射数收集处理相位求解模型建立修正等五步骤试验24蛋白样检测操作6 成功结晶解出结构[7]
X射线晶体学缺点分子晶体中锁定某状态晶体分子处基态构象均分子行功时发生激发态渡态X 射线晶体技术难捕捉分子动态信息[8]样X射线晶体学方法现会蛋白质结构研究方法
32核磁振波谱学(nuclear magnetic resonanceNMR)
核磁振波谱学 X 射线晶体学力补充1971 年利时科学家J Jeener 提出二维核磁振概念1985 年Kurt Wüthrich 基础发明种新方法选择生物分子中质子(氢原子核)作测量象连续测定相邻两质子间距离方位数计算机处理形成生物分子三维结构图KurtWüthrich 该方法测定蛋白质三维结构奠定NMR作确定生物分子手段获2002 年诺贝尔化学奖时日NMR已成确定生物分子溶液三维空间结构手段[9]
NMR技术缺点测定蛋白中等蛋白质分子(相分子质量般30000)图谱分析工作极费时需数月年时间导致实验周期延长速度缓慢外核磁振衍射技术反应溶液中进行研究象必须溶蛋白溶蛋白研究较困难样品需位素标记等定程度制约NMR技术应着新技术发现G矩阵傅立叶变换式NMR(Gmatrix fouriertransform NMRGFTNMR)技术等NMR发展速度快目前PDB中收录蛋白质结构15％左右利NMR方法解析快速发展功方面：仪器技术断发展计算速度飞速提升实验方法断创新发展[8]1990年前均年解10结构现均天解2 结构相信着NMR技术断改进发展NMR技术未结构生物学贡献会越越
33圆二色光谱 (CD)
光学活性分子左右圆偏振光吸收左右圆偏振光透变成椭圆偏振光种现象圆二色性(Circular Dichroism简称ＣＤ)蛋白质具特定结构生物分子氨基酸通肽键连接成具级结构二级结构三级结构四级结构结构层次结构域超二级结构蛋白质肽分子中肽链骨架中肽键芳香氨基酸残基二硫桥键光活性生色基团面圆偏振光通时生色基团左右圆偏振光吸收造成偏振光矢量振幅差圆偏振光变成椭圆偏振光产生蛋白质圆二色性[10]圆二色光谱种差光谱样品左右旋偏振光射吸收光谱差值[11]
34FTIR
蛋白质结构研究代生物化学领域研究基容 蛋白质结构复杂变性形成复杂生物组织前提基础 许生理功实现蛋白质结构密切相关 着生命科学进步 仪器分析手段更新 傅立叶变换红外光谱(FTIR)附件发展运 尤年FTIR结构功方面应崛起 领域发展突飞猛进
FTIR技术蛋白质结构研究具优点：(1)需材料少受分子量影响 (2)适合种状态样品(3)受光散射 荧光影响(4)适合种环境 (5)易测定蛋白质瞬间结构特征 说明蛋白质生理状态结构功关系(6)操作简便 测量速度快
[12]
4蛋白质结构领域中应
41结构基组学中应
目前预测技术水[13]预测结果精确度X射线衍射分析NMR等实验手段蛋白质结构预测规模低成快速获三维结构效途径例目标蛋白质模板蛋白质序列相似性超30时结构预测方法建立蛋白质三维结构模型般性功分析蛋白质预测技术结构基组学中广泛应
2001年Dmitrijetal建立基组序列数进行高通量分析软件系统PEDANT相应基组分析服务器 PEDANT包括输入模块处理单元关系数库理系统户界面4模块应PEDANT预测拟南芥染色体IV识出3744编码蛋白质基基相应蛋白质中90蛋白质数库中搜索显著BLAST匹配2002年Scottetal开展极端嗜热菌海栖热袍菌(Thermotogamaritima)蛋白质组结构基组学高通量结构测定通道利测定通道成功克隆表达1376基占总预测数(1877)73分析432蛋白质结晶条件占蛋白质组232003年Manesh etal建立基串线法技术蛋白质结构预测动通道PROSPECT线虫(C elegans)嗜热菌(Pyrococcus furiosus)3种蓝细菌(cyanobacterial)基组进行结构基组学预测[14]
42药物设计中应
基组数新药物程分2部分：选择目标蛋白二选择合适药物[12]药物分子必需目标蛋白质分子紧密结合容易合成没毒副作传统药物设计通筛选量天然化合物已知底物配基类似物(analogs)生物化学研究确定前导物(lead compounds)较少赖目标蛋白质三维结构研发周期长费巨带少盲目性着蛋白质结构数增长结构预测技术发展目标蛋白质分子三维结构信息述2程发挥着越越作计算机辅助药物设计(computeraided drug design)缩短研发周期降低成例2003年Xiang etal
[14]应源建模方法建立SARS冠状病毒赖RNA聚合酶(SARSCov RdRp)分子模型抗SARS药物设计具重作
43蛋白质设计中应
蛋白质设计目标通计算机辅助算法生成符合目标蛋白质三维结构氨基酸序列漫长进化然界已筛选出数量众蛋白质天然蛋白质然条件发挥佳功利蛋白质受限制需蛋白质进行改造适应特定条件发挥特定功蛋白质分子设计分3类改中改改[15]
参考文献：
[1]李明苏显中敏郑全喜 蛋白质结构预测研究进展[J] 生物技术2009038790
[2]郭雨珍冯恩民 蛋白质结构研究现状展[J] 生物信息学200704182184
[3] 哀慧君 蛋 白质结构功研究进展新生肤链折叠[J] 河南职技师院学报1997033334
[4]阎隆飞孙荣蛋白质分子结构[M]北京清华学出版社1999211 213
[5]SwissProtSwissProtProteinKnowledgebaseRelease495Statistics[EBOL][2006 02 14] httpwww expasy ch sprotrelnotes relstat html
[6]宁正元林世强蛋白质结构预测应[J]福建农林学学报(然科学版)200605308311
[7] Pantazatos D Kim J S Kolck H E et al Rapid refinementof crystallographic protein construct definition employingenhanced hydrogendeuterium exchange MS Proc Natl AcadSci USA 2004 101(3) 751756
[8]蛋白质结构研究方法进展科学热点[Z]江南学图书馆情报部 2006 (2)
[9]阎隆飞 孙荣 蛋白质分子结构[M]北京 清华学出版社 1997 131154
[10]沈星灿梁宏锡文王新省圆二色分析蛋白质构象方法研究进展[Ｊ]分析化学评述进展2004(3)388～394
[11]丁晓岚高红旗圆二色光谱技术应实验方法[Ｊ]实验技术理200825(10)48～52
[12]王建华卫亚丽文宗河建川蛋白质结构 FTIR研究进展[J] 化学通报2004482
[13]刘东升王金凤结构基组学研究核磁振[J]生物化学生物物理进展200128(6)827 831
[14] 宁正元林世强蛋白质结构预测应[J]福建农林学学报(然科学版)200605310311
[15]鲁华蛋白质结构预测分子设计[M]北京北京学出版社1993100 105
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