- 1. 结构化学选读
- 2. 课程基本目的生物大分子结构与生物分子识别的基本原理
研究生物大分子结构与识别的生物物理化学方法
生物大分子结构与生物分子识别研究进展
- 3. 课程主要内容1、蛋白质及核酸结构原理
2、蛋白质结构预测方法
3、蛋白质折叠研究
4、用于蛋白质、核酸构象研究的光谱学方法 (紫外、荧光、圆二色光谱等)
5、生物分子识别研究的物理化学方法 (等温滴定量热,超速离心等)
6、 生物大分子结构测定
7、蛋白质及药物分子设计
- 4. 蛋白质结构分类:
球蛋白(水溶性蛋白)
膜蛋白
纤维蛋白
- 5. 蛋白质功能分类催化功能
运输功能
营养和贮存功能
收缩和运动功能
结构功能
防御功能
调控功能
其它
- 6. 蛋白质折叠问题蛋白质序列、结构、功能
序列结构功能
- 7. 有关的蛋白质结构数据库蛋白质晶体结构数据库
Brookhaven PDB (生物信息服务器)
RCSB-PDB (http://www.rcsb.org)
蛋白质结构分类库
SCOP
CATH
PDBSUM
- 8. 一级结构 二级结构 三级结构 四级结构
- 9. 蛋白质的一级结构20种氨基酸残基由肽键相连成的序列
AGPFSCHEDSGPFCSFPGA?..
- 10. 蛋白质结构原理
1、20种标准氨基酸
疏水性Ala Val Leu Ile Phe Pro Met
带电:Arg Lys Asp Glu (His)
极性:Ser Thr Cys Asn Gln His Tyr Trp
特殊:Gly (Pro)
2、多肽链状结构
3、二硫键
CYS-S-H + H-S-CYS CYS-S-S-CYS
- 11. 20种标准氨基酸
疏水性Ala Val Leu Ile Phe Pro Met
带电:Arg Lys Asp Glu (His)
极性:Ser Thr Cys Asn Gln His Tyr Trp
特殊:Gly (Pro)
- 12. 氨基酸的稳定性与后修饰Cys, Met
Asn
Ser, Thr, Tyr
Gly
Pro
- 13. His0.360
Cys0.210
Ser0.130
Lys0.100
Thr0.100
Asn0.080
Arg0.055
Gln0.050
Glu0.050
Asp0.045
Ala0.025
Met0.025
Ile-0.005
Tyr-0.040
Val-0.060
Gly-0.070
Phe-0.120
Trp-0.140
Leu-0.180
Pro-0.200
氨基酸残基在活性部位出现的几率